Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Apobec3Q99J72 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms