Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Prpf39Q8K2Z2 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Prpf39Q8K2Z2 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Prpf39Q8K2Z2 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Prpf39Q8K2Z2 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Prpf39Q8K2Z2 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Prpf39Q8K2Z2 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Prpf39Q8K2Z2 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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