Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Traf3Q60803 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Traf3Q60803 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Traf3Q60803 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Traf3Q60803 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Traf3Q60803 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Traf3Q60803 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.3 ms