Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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