Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Rps29P62274 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rps29P62274 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rps29P62274 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rps29P62274 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rps29P62274 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rps29P62274 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rps29P62274 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rps29P62274 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rps29P62274 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms