Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprmP28828 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprmP28828 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprmP28828 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms