Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RxraP28700 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RxraP28700 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms