Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms