Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms