Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Rabgef1Q9JM13 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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