Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Usp29Q9ES63 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms