Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SgshQ9EQ08 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms