Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Ccdc47Q9D024 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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