Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pagr1aQ99L02 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms