Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Ccdc88cQ6VGS5 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc88cQ6VGS5 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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