Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NipblQ6KCD5 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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