Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Usp48Q3V0C5 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms