Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ccdc34Q3UI66 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ccdc34Q3UI66 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ccdc34Q3UI66 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc34Q3UI66 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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