Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Trafd1Q3UDK1 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms