Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Ttc39dQ0VF76 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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Ttc39dQ0VF76 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Ttc39dQ0VF76 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ttc39dQ0VF76 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ttc39dQ0VF76 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ttc39dQ0VF76 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ttc39dQ0VF76 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ttc39dQ0VF76 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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Ttc39dQ0VF76 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ttc39dQ0VF76 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms