Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Pkp1P97350 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Pkp1P97350 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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