Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PtprmP28828 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PtprmP28828 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms