Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm3415J3QMS8 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3415J3QMS8 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms