Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms