Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Grik3B1AS29 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms