Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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Rabgef1Q9JM13 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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Rabgef1Q9JM13 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Rabgef1Q9JM13 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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