Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms