Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg3Q9CPX6 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms