Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms