Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 AC129935.1-201ENSMUST00000226302 873 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Fam20bQ8VCS3 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms