Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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Gm28047Q3US59 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Gm28047Q3US59 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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Gm28047Q3US59 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Gm28047Q3US59 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Gm28047Q3US59 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Gm28047Q3US59 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Gm28047Q3US59 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Gm28047Q3US59 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Gm28047Q3US59 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Gm28047Q3US59 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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