Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rpusd3Q14AI6 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms