Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SftpdP50404 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SftpdP50404 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms