Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PtprkP35822 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprkP35822 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PtprkP35822 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PtprkP35822 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PtprkP35822 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PtprkP35822 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PtprkP35822 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PtprkP35822 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PtprkP35822 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PtprkP35822 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PtprkP35822 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PtprkP35822 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms