Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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MttpO08601 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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MttpO08601 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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MttpO08601 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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MttpO08601 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MttpO08601 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
MttpO08601 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.3 ms