Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms