Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Spocd1B1ASB6 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Spocd1B1ASB6 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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