Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms