Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms