Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf4Q9QZS2 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf4Q9QZS2 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf4Q9QZS2 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf4Q9QZS2 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf4Q9QZS2 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf4Q9QZS2 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf4Q9QZS2 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf4Q9QZS2 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf4Q9QZS2 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rnf4Q9QZS2 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms