Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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Bco1Q9JJS6 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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Bco1Q9JJS6 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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Bco1Q9JJS6 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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Bco1Q9JJS6 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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Bco1Q9JJS6 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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Bco1Q9JJS6 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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Bco1Q9JJS6 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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Bco1Q9JJS6 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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Bco1Q9JJS6 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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Bco1Q9JJS6 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Bco1Q9JJS6 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Bco1Q9JJS6 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Bco1Q9JJS6 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Bco1Q9JJS6 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Bco1Q9JJS6 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Bco1Q9JJS6 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Bco1Q9JJS6 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Bco1Q9JJS6 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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