Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smg9Q9DB90 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms