Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ccdc47Q9D024 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms