Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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PtprtQ99M80 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PtprtQ99M80 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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