Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CipcQ8R0W1 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CipcQ8R0W1 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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