Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccdc88cQ6VGS5 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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