Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Shank3Q4ACU6 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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