Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Usp48Q3V0C5 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms