Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Q3U6N9 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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