Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms